Urząd Celno-Skarbowy działa na podstawie:
1) ustawy z dnia 16 listopada 2016 r. o Krajowej Administracji Skarbowej (tekst jednolity: Dz. U. z 2018 r., poz. 508 ze zmianami);
2) ustawy z dnia 16 listopada 2016 r. – przepisy wprowadzające ustawę o Krajowej Administracji Skarbowej (Dz. U. z 2016 r., poz. 1948 ze zmianami);
3) ustawy z dnia 27 sierpnia 2009 r. o finansach publicznych (tekst jednolity: Dz. U. z 2017 r., poz. 2077 ze zmianami);
4) zarządzenia Ministra Rozwoju i Finansów z dnia 1 marca 2017 r. w sprawie organizacji jednostek organizacyjnych Krajowej Administracji Skarbowej oraz nadania im statutów (Dz. Urz. Min. Rozw. i Fin. poz. 41);
5) przepisów odrębnych;
6) regulamin organizacyjny Zachodniopomorskiego Urzędu Celno-Skarbowego w Szczecinie.
Naczelnik jest organem Krajowej Administracji Skarbowej.
Naczelnik wykonuje swoje zadania przy pomocy Urzędu Celno-Skarbowego.
W sprawach organizacyjno-finansowych obejmujących obsługę finansową i kadrową, zarządzanie majątkiem, remonty i inwestycje, zamówienia publiczne, obsługę informatyczną, obsługę prawną, audyt wewnętrzny, kontrolę zarządczą, komunikację, zarządzanie bezpieczeństwem informacji, zarządzanie kryzysowe, sprawy obronne, ochronę osób i mienia, bezpieczeństwo i higienę pracy oraz ochronę przeciwpożarową Izba Administracja Skarbowej, wraz z podległymi urzędami skarbowymi i Urzędem Celno-Skarbowym, tworzy jednostkę organizacyjną.
